L’évêché de Lescar remplace l’évêché de Beneharnum en 980, après le pillage des Vikings. La cathédrale actuelle est construite en grès de Lasseube de 1120 à 1145 sur les ordres de l’évêque Guy de Lons. A la fin du XVe siècle, elle devient la nécropole de la famille d’Albret et des rois de Navarre. Jeanne d’Albret la fait vider alors de tout son décor sculpté. En 1569, rendue au culte catholique, elle est dévastée par les troupes protestantes de Gabriel Ier de Montgomery.
Son évêché a été transféré à Bayonne en 1801.

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